医院围绕创建JCI医院及三甲医院提出发展目标，并致力于打造人文关爱型医院。医院目前占地100余亩，医疗用房建筑面积10万平方米，核定床位1000张。现有中、高级以上职称人员350余名，其中硕、博士以上学历人员200余名。医院通过柔性引才等方式，聘请了一批国内外著名院士教授，如何奔，燕铁斌、刘晓谦、张高孟、林乌拉、叶朝阳等。医院还拥有一大批厦门百姓耳熟能详的名医专家，如崔立山教授、刘汉昌教授、李勇胜教授、钟鸿斌教授、陆凌云教授等等。医院还聘请中国工程院院士钟世镇、南方医科大学黄文华院长、美国休斯敦医学中心贝勒医学院终身教授蓝辉耀博士担任医学顾问。美国哈佛大学医学院研究院、新加坡医学院院士林延龄教授，中国科学院院士、遗传生物学专家贺林教授都会定期来五院参与临床医疗与教学指导工作。
医院设有职能业务科室16个，临床、医技科室50个。医院是厦门大学附属第一医院创伤救治基地、厦门市糖尿病研究所临床基地、厦门市心血管病研究所临床基地，也是厦门市肿瘤中心、厦门市泌尿中心、厦门市脑科中心的分中心。目前能够开展各种三、四级高难度手术，如：心脏搭桥、换瓣、断肢（指）再植、肝癌介入、心脏介入、烟雾病治疗、微血管减压术等。同时在各个外科广泛开展各种微创诊疗技术。医院还建立远程会诊中心，随时可以与北京解放军总医院、台湾慈济医学中心等国际国内一流医疗机构进行远程会诊。
国际标准化重症监护室
医院拥有最新一代螺旋CT、核磁共振、DSA、双板DR、四维彩超、乳腺钼靶、消化、呼吸腔镜等国际先进的高端医疗设备。新手术室完全按国际标准化进行建设，拥有可用于心胸外科、神经外科、器官移植等对洁净度要求高的手术间。完成急诊、ICU一体化建设，率先在省内推行急诊、ICU一体化抢救模式。
医院是多所医学高等院校的教学基地，目前在院见、实习生400余人。与泰山医学院联合举办了硕士研究生班，开设护理、临床、影像三个专业，共有140余名在职研究生在我院攻读学位。医院也是翔安区残疾人康复培训基地、厦门市乡村医生培训基地、福建医科大学博士研究生医疗实践基地。今年8月医院内科、外科、妇产科、全科四个住院医师规范化培训基地均顺利通过评审，目前已开始第一批住院医师的规范化培训。医院积极开展科研工作，成立了厦门市院士专家工作站、福建省院士专家工作站，并与中国科学院贺林院士共建基因诊断方向中心实验室。近三年来，我院申报多项科研项目获立项，资助金额达1000余万。
医院对患者秉承“仁心仁术、至诚至善，慈心呵护、爱在五院”的精神，对同仁倡导“同心协力、五院一家，慈心传承、爱在五院”的理念，开展了一系列“爱在五院”活动，如：在门诊大厅开展钢琴演奏；设立爱心导诊台，免费为患者提供咖啡、糖果等；启用免费穿梭电瓶车，院内接送病人等等。
